山形七日町ワシントンホテルYGH（山形県） ２００９年１１月１日オープン
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川根七曲宿YH（静岡県） ２００９年８月１日オープン
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入笠山湿原YH（長野県） ２００９年１月４日オープン
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別府湯けむりの丘YH（大分県） ２００８年１１月２０日オープン
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栃木・那須ハイランドリゾートYH（栃木県） ２００８年１０月１日オープン
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京都・宇多野YH（京都府） ２００８年７月１２日改装オープン
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横浜ベイサイドYH（神奈川県） ２００８年４月１０日オープン
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清水YH（京都府） ２００８年４月４日オープン
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臨時休館ユースホステル
| ふらのユースホステル（北海道） | 平成２１年１２月２７日～平成２２年５月３１日 |
| 青森・雲谷高原ユースホステル（青森県） | 平成２１年１０月１日～平成２２年４月１４日 |
| 北湯沢ユースホステル（北海道） | 当分の間 |
| 三次ユースホステル（広島県） | 平成２１年３月１日～平成２２年３月３１日 |
| ユースホステル木屋旅館（静岡県） | 当分の間 |
| 浜坂ユースホステル（兵庫県） | 当分の間 |
| 甲府ユースホステル（山梨県） | 当分の間 |
| 天草ユースホステル（熊本県） | 当分の間 |
| 松江レークサイドユースホステル（島根県） | 当分の間 |
| 箱根レイクヴィラユースホステル（神奈川県） | 当分の間 |
| 唐島荘ユースホステル（富山県） | 平成２３年３月末日まで |
| トレック石垣ユースホステル（沖縄県） | 当分の間 |
| 松山ダウンタウンユースホステル（愛媛県） | 当分の間 |
| るべしべユースホステル（北海道） | 当分の間 |
| 隠岐の島ユースホステル（島根県） | 当分の間 |
| 日田おおやま（大分県） | 当分の間 |
| 三保（静岡県） | 当分の間 |
閉館ユースホステル
| スカイコート浅草ユースゲストハウス（東京都） | 平成２１年１２月３１日 |
| 山中湖畔荘清渓ユースホステル（山梨県） | 平成２１年６月３０日 |
| 広島宮島口ユースホステル（広島県） | 平成２１年４月３０日 |
| 土樽山荘ユースホステル（新潟県） | 平成２１年４月１０日 |
| ユースホステル登別かんのんじ（北海道） | 平成２１年３月３１日 |
| 香宝寺ユースホステル（鳥取県） | 平成２１年１月１日 |
| 曽々木梶山ユースホステル（石川県） | 平成２０年１２月３１日 |
| スカイコート成田ＹＧＨ（千葉県） | 平成２０年１２月３１日 |
| ゑびすやユースホステル（島根県） | 平成２０年１２月３１日 |
| ユースホステル城福寺（島根県） | 平成２０年１２月３１日 |
| 三虎ユースホステル（岡山県） | 平成２０年１２月３１日 |
| 瀬戸田しまなみユースホステル（広島県） | 平成２０年１２月３１日 |
| スカイコート博多ＹＧＨ（福岡県） | 平成２０年１２月３１日 |
| 大山ユースホステル（鳥取県） | 平成２０年１０月３１日 |
| 扇が浜ユースホステル（和歌山県） | 平成２０年９月３０日 |
| 山口ユースホステル（山口県） | 平成２０年９月２６日 |
| 日本原高原ユースホステル（岡山県） | 平成２０年７月３１日 |
| 浅間温泉ユースホステル（長野県） | 平成２０年６月３０日 |